coriell的*設備和專業知識詳細介紹

發布時間： 2023-03-22　　點擊次數： 859次

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概述科里埃爾研究所致力于推進研究，為教師、學生和合作者提供支持基礎和轉化研究的*設備和專業知識。為此，我們的研究核心設施在廣泛的科學領域提供各種各樣的服務; 這些不同的資源提供儀器，技術專業知識，培訓和教育那些參與追求創新，端研究。這些設施擴大了調查人員的能力，促進了合作，加快了發現和翻譯的速度。

生物信息學可用的分析工作流程: RNA-seqChIP-seqATAC-seqWES/WGE 減少表示亞硫酸鹽定序(RRBS)微生物組宏基因組學(16S 測序) scRNA-seqscATAC-seqexample 標準輸出: 用于在 UCSC 或 IGV 上追蹤可視化的 RNA-seqC 報告文件(bigwig) ;BAM 比對文件可用于 requestRaw 基因計數表列出差異表達基因及其表達倍數變化和 FDR 校正的 p 值3可視化: PCA，熱圖，路徑的火山圖列表 RRBSQC reportBAM 比對文件(當請求時)所有檢測到的 CpG 位點的完整甲基化表具有 p 值(FDR 校正)的差異甲基化 CpG 位點的列表可視化: PCA 圖，熱圖,對于顯著甲基化的 CpGs 列表附近 genesscRNA-seqC 報告條形碼 BAM 比對文件可用(用于 GEO) UMI/Cell count tabletSNE 或 UMAP 聚類用于亞群列表差異表達基因列表及其表達倍數變化和 FDR 校正的 p 值基于聚類或實驗條件(兩者均為額外的2小時收費)。如果沒有基于聚類的亞群確定，差異表達將基于實驗條件進行。2可視化: 熱圖，火山圖路徑列表費用: 生物信息學分析起價每小時250美元。批量分析每個樣品的估計費用

流式細胞術和細胞分選 Coriell 流式細胞術設備能夠使用 BD FACSymphony (檢測最大16種顏色)和 SONY 分選細胞分選(無菌，速度高達20,000個細胞/秒)從基于多達6個熒光染料的均勻或混合細胞群體中進行流式細胞術分析，其可以同時分選多達兩個單獨的群體，包括 BSL-2水平的人源樣品。設施工作人員支持研究人員創建高效、低成本的實驗設計ーー即通過優化特定于細胞計數的試劑和熒光染料的選擇ーー并在分析儀器的操作方面提供協助。我們的設施還為流式和成像細胞術數據的分析提供技術支持，以便發表，介紹和納入贈款申請; 管理細胞術數據(存儲，歸檔和檢索) ; 以及管理低成本獲取后分析軟件的現場許可證。

基因組學和表觀基因組學基因組學，轉錄組學和表觀基因組學服務針對基因分型和突變分析的深度測序針對單個等位基因的 DNA 甲基化分析的亞硫酸氫鹽擴增子測序減少表征亞硫酸鹽定序(RRBS)用于全基因組分析的 DNA 甲基化16S 核糖體 DNA 測序用于微生物組分析 Bulk 和單細胞用于基因表達分析的 RNA-seq Bulk 和單細胞 ATAC-seq 用于染色質可及性的全基因組分析用于 DNA 結合蛋白和組蛋白修飾的全基因組作圖的 ChIP-seqS2聚焦超聲波儀 Pyromark Q24焦磷酸測序平臺 Applied Biosystems QuantStudio6 Flex 實時 PCR 儀器安捷倫生物分析儀2100Qbit 熒光計 NanoDrop 分光光度計 Invitrogen iBright CL1000凝膠成像儀

誘導多能干細胞科里爾的 iPSC 核心提供了多種服務，以滿足您的干細胞需求。Coriell 的 iPSC 實驗室擁有建立 hiPSC 系列的廣泛專業知識，使用包括仙臺病毒和附加質粒載體在內的不同方法重編程各種“親本”細胞類型。Coriell 擁有一大批明顯健康和疾病模式的 iPSC 系列，而且這些系列的數量還在不斷增加。疾病特異性細胞系包括神經系統疾病、單基因疾病和染色體異常。幾十年來，科里爾在幫助定義和實施生物樣本收集、加工(確保無菌性、完整性和真實性)、質量保證(QA)、質量控制(QC)、深低溫保存、樣本安全儲存、收集維護/庫存管理和分銷的最佳實踐方面發揮了關鍵作用。Coriell 公司的實驗室按照 ISO9001標準的嚴格的標準操作程序運作，細胞系資源經過全面的細胞系完整性和質量控制測試。就干細胞系而言，多能性和分化潛力的評估是使用各種技術平臺進行的。在 Coriell 進行的標準細胞系 QC 檢測(作為對科學界的一項服務)包括，但不限于: 生長和生存能力評估微生物和真菌不育檢測支原體檢測人類病原體檢測身份檢測(微衛星與親本細胞培養物匹配)細胞遺傳學 G 帶核型微陣列基因分型確認無整合重編程使用干細胞表面標記通過免疫細胞化學和/或流式細胞術和堿性磷酸酶染色體體外胚胎體(EB)檢測和定量分析三系分化潛能使用 RT-PCR 分析胚層特異性基因的表達多能性和三系分化潛能使用 Applied Biosystems TaqMan hPSC Scorecard Panel。

動物和異種移植科里爾動物和異種移植核心提供了廣泛的服務，以協助異種移植動物研究的設計和實施。Core 公司擁有一個大型的免疫缺陷(NSG)小鼠繁殖群(約30對) ，以滿足客戶的需求。實驗動物被安置在我們 NSG 專用的 BSL-2空間，該空間全配備了手術和生存手術所必需的所有設備。該設施的能力包括方位的異種移植模型，包括移植到 NSG 小鼠中的人 CD34 + 細胞，血液惡性腫瘤(AML，ALL)的原位患者衍生的異種移植(PDX)模型和實體瘤(即肝，卵巢，腦，肺)模型。聯系連博士，

Coriell 的 Organoid Core 提供了多種3D 細胞培養模型，以滿足研究人員的需要。3D 細胞培養模型，如類器官和球體，更接近地概括了細胞結構和細胞在體內自然生長的微環境。3D 模型的進步為器官發生、疾病建模和藥物治療提供了寶貴的研究機會。憑借 Coriell 在多種細胞類型和疾病模型方面的長期經驗，我們已經優化了許多方案，以適應細胞系到細胞系和疾病模型的變化。高質量的細胞培養模型和工具是三維細胞培養成功的關鍵。Coriell 的 Organoid Core 能夠為所有3D 細胞培養模型提供一致的可重復結果。

細胞成像科里爾細胞成像核心為新澤西州南部地區的研究人員提供了前沿光學成像能力。我們提供激光掃描和旋轉圓盤共聚焦顯微鏡，光片顯微鏡，超分辨率顯微鏡技術和寬視場顯微鏡用于固定和實時成像。我們的特色共聚焦顯微鏡是奧林巴斯 fv3000共聚焦顯微鏡，使廣泛的成像模式，包括宏觀顯微成像，超分辨率顯微鏡技術和定量數據分析。奧林巴斯 FV3000的其他關鍵特性是: TruSpectal 高靈敏度多通道成像系統使用專有的光譜檢測技術，FV3000共聚焦顯微鏡的 TruSpectal 探測器結合了高靈敏度和光譜靈活性，甚至可以檢測到最暗的熒光團。與傳統的光譜探測技術相比，它的光傳輸能力提高了3倍。它還有獨立的可調通道，以優化每個熒光團的信號檢測。它的 lambda 掃描模式使得復雜的重疊熒光信號能夠精確的光譜分解。FV3000顯微鏡的宏觀到微觀的工作流程為數據采集提供了一個路線圖，使你能夠在上下文中看到數據，并輕松定位感興趣的區域以獲得更高分辨率的成像。它使用一個低放大率1.25 X 或2倍的物鏡來快速捕捉整個標本的大視場(FOV)地圖。它可以識別覆蓋地圖上感興趣的區域，然后切換到一個更高的放大率目標的高分辨率共焦成像到120納米奧林巴斯超分辨率技術(FV-OSR)。

FV3000RS 混合掃描單元使用振鏡掃描儀進行精確掃描，同時使用共振掃描儀，非常適合對活體生理事件進行高速成像。它可以使用共振掃描儀以大視場捕捉視頻速率圖像，其特點是使用剪輯掃描，速度從30幀率(fps)到最高438幀每秒(fps)。精確的時間延遲成像時間延遲實驗需要一致的焦點和低光毒性的樣品。奧林巴斯的 TruFocus 設備有助于在活細胞成像過程中保持聚焦，盡管溫度發生變化或添加了試劑。FV3000顯微鏡的高靈敏度探測器需要的激光功率明顯減少，而共振掃描儀減少激光照明時間，降低光毒性，為更多的生理準確的共焦成像數據。由于硅油的折射率接近于活體組織，因此硅油目標可以在組織內部以最小的球面像差進行高分辨率的觀察。它的折射率匹配提供了一個理想的焦距體積，導致完的體積重建，并使大型生物體的高分辨率共焦成像。它的長距離工作能夠在深度上進行詳細的顯微成像。利用三維重建軟件，可以實時觀察數據的展開情況，并且可以方便地觀察結構。

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